最新營養科學的文獻回顧性評論，強調了喝咖啡對消化過程的好處，以及降低膽結石和某種肝臟疾病的發生。
整合194個發表過的研究的結論指出：飲用適度的咖啡 (每天3-5杯)，對消化道的各種器官並不會造成傷害。其中有兩個特別值得注意的地方 ─咖啡和減少膽結石以及減少胰臟發炎風險相關─ 雖然仍需要更多研究。
咖啡經過胃腸時有三個主要影響：
1) 咖啡和胃、膽囊及胰臟的分泌有關。咖啡刺激消化荷爾蒙胃泌素和鹽酸，兩者在胃液中協助分解在胃裡的食物。咖啡也刺激膽囊收縮素(CCK)的分泌，這是一種增加膽汁製造的荷爾蒙，也幫助消化。
2) 咖啡促使腸道微生物菌群的組合變化，主要是益生菌雙歧桿菌Bifidobacteria數量的增加。
3) 咖啡和穀麥片一樣會刺激大腸蠕動，比無咖啡因的咖啡多23%，比一杯水多60%。它可能和減少慢性便秘風險相關。
最近的研究也強烈支持咖啡有對抗肝臟疾病的保護作用，包括最常見的肝癌 ──肝細胞癌。
除了證據指出飲用咖啡有助於初階的消化，大部分的數據並不支持咖啡對胃食道逆流有直接的影響。胃食道逆流是其他風險因子組成或加成的影響，如肥胖和不良飲食。
這個新的評論，標題為「咖啡對胃腸道的影響：敍述性綜論和文獻回顧」，由法國健康和醫學研究的國家機構的名譽研究主管Astrid Nehlig博士所主導。
他說：「和一些假設相反，飲用咖啡總體來說，和排便或消化問題並沒有關連。在某些情況下，咖啡對一般消化不良如便秘，有保護作用。越多的資料指出腸道細菌群，如益生菌雙歧桿菌量的增加和飲用咖啡相關。雖然需要更多的數據來了解咖啡在消化道上的影響，這個起點十分令人鼓舞。」
此回顧性研究由非營利「咖啡科學資訊機構」(ISIC)所資助。